Koordynator Projektu OSW Środkowy Wschód od stycznia 2025 r. W latach 2001–2024 kierownik Zespołu Turcji, Kaukazu i Azji Centralnej. Ponadto organizator i koordynator programów badawczych OSW: Program chiński OSW (2018–2022), Program Izraelski (2019–2022), oraz projektów badawczych OSW związanych z Bliskim i Środkowym Wschodem (Iran – od 1999, wojna z terroryzmem i Afganistan – od 2001, Irak – od 2003, kwestie kurdyjskie – od 2006, Arabska Wiosna – 2011) oraz islamem (m.in. Islam na obszarze postsowieckim 2003–2004). W OSW od 1999 r.
Wykładowca w Studium Europy Wschodniej (SEW) Uniwersytetu Warszawskiego (historia i współczesność Azji Centralnej i Kaukazu Południowego; metodologia analityczna).
Non-resident scholar w Middle East Institute – Black Sea Program (MEI, Washington D.C), visiting fellow w MEI (2023)
Regularnie publikuje w „Tygodniku Powszechnym” i wykłada w College of Europe w Natolinie.
- wyzwania dla stabilności i ewolucja polityczno-społeczna na Środkowym Wschodzie (Syria, Irak, Iran, Afganistan)
- Kaukaz Południowy i Azja Centralna oraz Turcja – przemiany polityczne i społeczne
- Wojna wraca do Syrii, Tygodnik Powszechny, 4 grudnia 2024
- Wrogowie idealni, Tygodnik Powszechny, 19 kwietnia 2024
- Państwo Islamskie Chorasanu – nowa odsłona światowego dżihadu, Komentarz OSW, marzec 2024
- Armenian Fate [w:] Slanted’s Special Issue Georgia/Armenia, marzec 2024
- Bliski Wschód coraz bliższy, Tygodnik Powszechny, 6 marca 2024
- With Russia’s future uncertain, Turkey and the West need each other Middle East Institute, October 18, 2023
- Mastering the growing crisis in the South Caucasus: A role for the West and Turkey, Middle East Institute, July 10, 2023
- Niewypowiedziana wojna. Nowy etap konfliktu azerbejdżańsko-armeńskiego, Komentarz OSW, marzec 2023 [współautor Wojciech Górecki]
- Erozja postsowieckiego systemu w Azji Centralnej, Komentarze OSW, wrzesień 2022 [współautor Miłosz Szymański]
- Rewolta w Kazachstanie. Czy antropologiczne pojęcia rodu i klanu pozwalają wyjaśnić sytuację społeczno-polityczną w Azji Centralnej? [dyskusja redakcyjna; współuczestnik] Societas/Communitas 2 (32) 2021, s. 13–36, Warszawa 2022
- Tureckie dylematy w cieniu wojny na Ukrainie, Komentarz OSW, lipiec 2022
- Ostrożność i wyczekiwanie. Turcja wobec wojny rosyjsko-ukraińskiej. Komentarze OSW, marzec 2022
- Koniec fantomowego imperium. Jak Rosja traci Kaukaz i Azję Centralną [w:] Rozpad starego świata. Próba syntezy po pół roku wojny na Ukrainie. Raport specjalny Klubu Jagiellońskiego, Warszawa 08.2022
- The Shadow Line: Turkey and the Arab Spring [in:] Politics of Change In Middle East and North Africa since Arab Spring. ed. Md. Muddassir Quamar MEI@ND New Delhi 2022, pp. 201–218
- Tureckie dylematy w cieniu wojny na Ukrainie, Komentarze OSW, nr 461, 1.07.2022
- Ostrożność i wyczekiwanie. Turcja wobec wojny rosyjsko-ukraińskiej. Komentarze OSW, nr 429, 10.03.2022
- Kaukaz rozregulowany. Region w rocznicę zakończenia drugiej wojny karabaskiej, Komentarze OSW, nr 418, 26.11.2021 [współautor Wojciech Górecki]
- Laboratorium czarnoksiężnika [Wojna w Syrii], Tygodnik Powszechny, 08.03.2021
- Kirgistan po kolejnej rewolucji, Komentarz OSW (359), 29.10.2020 [współautor Mariusz Marszewski]
- Dwie Turcje, Tygodnik Powszechny, 05.10.2020
- Wojna czterdziestoletnia [Iran-USA], Tygodnik Powszechny 10.01.2020
- S-400 dla Turcji. Eskalacja kryzysu w stosunkach turecko-amerykańskich Komentarze OSW, nr 305, 12.06.2019 [współautorem Andrzej Wilk]
- Wszystkie drogi prowadzą przez Kirkuk, Tygodnik Powszechny, 31.07.2017
- Referendum konstytucyjne – kolejny krok w stronę Nowej Turcji, Komentarze OSW, 28.04.2017
- Rok przełomu w stosunkach turecko-unijnych – próba bilansu, Krzysztof Strachota, Mateusz Chudziak, Komentarze OSW, 18.10.2016
- Nie ma jednego islamu [w:] Między Berlinem a Pekinem red. Łukasz Warzecha, Warszawa 2016
- Sny z tysiąca i jednej nocy, Nowa Europa Wschodnia (6/2015), s. 130–136
- Raport: Kurdowie [Office for Foreigners], Warszawa 2015
- Turcja a problem uchodźców syryjskich; Krzysztof Strachota, Aleksandra Jarosiewicz, Komentarze OSW, 1.10.2015
- Bliski Wschód w cieniu Państwa Islamskiego, Punkt Widzenia OSW, Warszawa, sierpień 2015
- Kryzys w Iraku a meandry tureckiej polityki bliskowschodniej, Komentarze OSW, 30.04.2014
- Chiny a Azja Centralna. Dorobek dwudziestolecia, Prace OSW (45), Warszawa 2013
- The Myth of the Afghan Threat and a New Reality in Central Asia on the Threshold of 2014, Caucasus International, Vol. 3 No: 3 Autumn 2013
- Turcja i węzeł kurdyjski. Przewartościowania w cieniu kryzysu na Bliskim Wschodzie, Punkt Widzenia OSW, Warszawa, styczeń 2013
- Wojna nerwów z Iranem – konsekwencje dla Kaukazu Południowego i Rosji, Komentarze OSW, 25.04.2012
- Central Asia and the Challenge of Afghan Stability [w:] Afghanistan in transition. Crafting a strategy for enduring stability, red. Beata Górka-Winter and Bartosz Wiśniewski, PISM, Warsaw 2012
- Azja Centralna. Charakterystyka regionu w kontekście stabilności i wyzwań migracyjnych, Warszawa 2011
- Central Asia [w:] Future Scenarios for The Conflict in Afghanistan: A Regional Perspective, red. A.Ananicz, CSM Reports and Analyses, Warszawa 2010
- Dżihad i Nowa Wielka Gra. Paradoksy zagrożenia wojującym islamem w Azji Centralnej, Krzysztof Strachota, Maciej Falkowski, Punkt Widzenia OSW, Warszawa 2010
- Para-States, Quasi-States, and Black Spots: Perhaps Not States, but Not "Ungoverned Territories," Either. Bartosz H. Stanislawski, Katarzyna Pełczyńska-Nałęcz, Krzysztof Strachota, Maciej Falkowski, David M. Crane and Melvyn Levitsky [w:] International Studies Review Vol. 10, No. 2 (Jun., 2008), pp. 366–396 (31 pages)
- Reintegracja czy rekonkwista? Gruzja wobec Abchazji i Osetii Południowej w kontekście uwarunkowań wewnętrznych i międzynarodowych, Krzysztof Strachota, Wojciech Bartuzi, Punkt Widzenia OSW, Warszawa, kwiecień 2008
- O niezawisły Kurdystan 1920–2006 [w:] Konflikty kolonialne i postkolonialne w Afryce i Azji 1869–2006, red. P. Ostaszewski, Warszawa 2006
- Vademecum żołnierza – Irak (rozdziały: Kraj, Ludzie, Religia, Kultura, Informacje praktyczne), Warszawa 2003
- Islam na obszarze postsowieckim, (redakcja; “Islam w Azji Centralnej”; ”Islam w europejskiej części WNP”; “Islam w Tadżykistanie”), Prace OSW, Warszawa 2002
- Konflikty na obszarze postsowieckim, (redakcja; “Konflikty...”; “Wojna w Tadżykistanie”), Prace OSW, Warszawa 2002
- Russian Policy in the Caucasus and Central Asia [w:] Toward Understanding of Russia, New York 2002 (Council for Foreign Relations)